分野：水環境工学、環境リスク評価
研究内容：下水道由来肥料・飼料の利用が動植物代謝・食品成分・腸内薬剤耐性へ与える影響評価。

分野：生物有機化学
研究内容：食品の香気成分の高度化測定手法の開発。

分野：生物有機化学、天然物化学
研究内容：ゲノム情報等を活用した機能性分子の探索。

分野：園芸学（果樹）
研究内容：果樹（特にサンカオウトウ・セイヨウナシ等）の機能性成分評価・加工変動解析・育種効率化および在来作物の保存・普及研究。

分野：応用微生物学、環境微生物学
研究内容：環境微生物の生理・生態・多様性の解明と、新規微生物の分離および有効活用。

分野：植物種子科学、植物生殖学
研究内容：160年ぶりに見出された植物新組織「笠原ゲートウェイ」を用いた種子食用作物の種子肥大化育種、有用植物の製糖作物化育種。

分野：食品機能学
研究内容：地域食材の機能性成分分析と健康機能の評価。

分野：植物生化学
研究内容：環境条件に応じた植物細胞壁特性と関連代謝物の解析。

分野：食品栄養科学
研究内容：食品抽出物からフェロトーシス抑制成分の探索と活性成分同定。

分野：農業環境工学、農業情報工学
研究内容：人工知能を用いたデータ解析による作物の栽培技術および家畜の飼育管理技術の高度化。

分野：ヤマダイミズアブ学、応用生態学
研究内容：ミズアブを軸にした肥料・飼料・養鶏・製薬・熟成米等の地域循環型食料・畜産・観光モデルの構築。

分野：天然物有機化学
研究内容：根圏微生物による根分泌物変化・共生代謝機構の解明と有効成分のメタボローム解析（ニームケーキ等含む）。

分野：分子生物学・生化学、生物有機化学
研究内容：イネの耐病性に関わるジテルペン合成酵素の機能進化と庄内米における分布。

分野：作物生産学、環境情報学、農業リモートセンシング
研究内容：地域内資源を活用した持続可能な食料生産システムの構築、東北日本海側多雪多雨地域におけるラーメン小麦の開発と普及。

分野：野菜園芸学
研究内容：クチクラ物性変動が代謝産物（脂質・フェノール類等）に与える影響解明および果実表面の艶の成分解析。

分野：環境工学
研究内容：持続可能な食料生産、気候変動レジリエンス、および新興汚染物質管理のためのバイオ炭および下水由来資源の活用。

分野：作物育種学
研究内容：ダダチャマメの香りを指標としたマルチオミクス解析と育種応用。

分野：家畜管理学
研究内容：未利用資源を用いた納豆菌培養基材の探索とAIによる家畜飼養管理の高度化。

分野：植物生理、代謝生化学
研究内容：抽出法・質量分析計の違いがメタボローム解析結果に与える影響の可視化。

分野：バイオインフォマティクス、システム生物学
研究内容：香り成分×メタボローム解析による日本酒テイスティングノーツ自動生成システムの開発。

分野：分析化学、メタボロミクス、食品科学
研究内容：NMRを用いた土壌・植物由来有機物の高精度分析法の開発。

分野：バイオインフォマティクス、システム生物学、合成生物学
研究内容：微生物による食料・素材生産のためのゲノム設計基盤の構築。

分野：メタボロミクス、バイオインフォマティクス
研究内容：農作物サンプルのメタ情報とメタボロームを統合管理するデータプラットフォームの構築。

分野：メタボロミクス、分析化学
研究内容：高感度メタボローム解析による機能性代謝物の探索と定量技術の構築。

分野：腸内デザイン学、統合オミクス科学
研究内容：腸内環境を介した食品の健康効果と有機廃棄物の微生物的再利用に関する統合研究。

分野：植物生理学、野外オミクス
研究内容：植物の環境応答制御のためのトランスクリプトーム解析・ゲノム編集技術の開発。

分野：プロテオミクス、分子生物学
研究内容：食品の風味・品質を規定する酵素群のプロテオーム定量技術の確立。

分野：合成生物学、生化学、ケミカルバイオロジー
研究内容：ブドウ由来天然酵母の単離と白ワイン醸造への応用。